Boinc - Распределенные вычисления в Астрономии

[SETI_home_v8]

Немного статистики о "мощности" проекта RakeSearch.

Завершение поиска с очень длинными (до 5 дней расчёта!) заданиями, который продлился с конца мая по начало августа, позволило вновь собрать данные по обработанным заданиям и обновить статистику по производительности проекта, как за всё его время существования, так и за время экспериментов Эдуарда Ватутина, ставших, по сути, отдельной "инкарнацией" в жизни проекта.

Первые два графика - "мощность" в TFLOPS-ах и среднем количестве вычислительных потоков за сутки за всё время существования проекта. Глядя на первый график надо держать в уме то, что на первом этапе широко использовалось оптимизированное приложение, из-за чего оценка за выполненные задания была многократно выше. Именно из-за этого в левой части первого графика наблюдаются такие большие пики.

Графики № 3 и 4 - также усреднённая за сутки мощность в TFLOPS-ах и количестве вычислительных потоков, но уже во время расчётов заданий от Эдуарда.

Показатель "Среднее число CPU" был рассчитан образом, несколько отличным от того, что использовался для предыдущих графиков - для некоторых поисков, в силу особенностей взаимодействия приложения и BOINC Wrapper-а, затраченное процессорное время надо учитывать не по показателю CPU time, которое сохраняется неточно, а по показателю Elapsed time, которое его, как раз хорошо отображает. Из-за этого "зелёные графики" выглядят несколько отличными от предыдущих.
Резкое падение показателей в самом конце связано с тем, что за последние 2-3 данные ещё неполны.

Большое спасибо за поддержку всем участникам проекта!

https://vk.com/photo-34590225_457239552

[SETI_home_v8]

Картирование маркеров артрита

Проблема

Псориаз — воспалительное заболевание кожи, поражающее более 125 миллионов человек во всем мире и ежегодно требующее расходов на здравоохранение свыше 135 миллиардов долларов ( https://www.psoriasis.org/psoriasis-statistics ). Это не косметическая проблема, но оно снижает качество жизни, особенно у женщин и молодых людей.

Псориатический артрит (ПсА) — это заболевание, вызывающее воспаление суставов, которое поражает примерно каждого третьего человека с псориазом. Симптомы ПсА включают боль, отёк и скованность суставов, боль в сухожилиях, изменение толщины или цвета ногтей, а также могут приводить к боли и покраснению глаз. У многих людей с ПсА наблюдаются «обострения», при которых симптомы могут периодически ухудшаться, а затем на какое-то время улучшаться. При адекватном лечении многие люди с ПсА могут вести полноценную и активную жизнь. Однако примерно в 5% случаев может развиться более тяжёлая и разрушительная форма ПсА, вызывающая деформацию суставов кистей и стоп.

Помимо симптомов, псориатрический артрит может вызывать проблемы со сном и трудности с выполнением повседневных задач. У некоторых пациентов симптомы также могут вызывать чувство застенчивости и стресс.

Хотя причины псориатрического артрита до конца не изучены, генетическая предрасположенность может предрасполагать к развитию псориатрического артрита, который затем может быть спровоцирован такими факторами окружающей среды, как инфекция, несчастный случай, травма, избыточный вес или курение. В настоящее время псориатрический артрит неизлечим, но ревматологи могут помочь пациентам с псориатическим артритом контролировать симптомы, используя различные лекарственные препараты, такие как нестероидные противовоспалительные препараты (НПВП) и базисные противовоспалительные препараты (БПВП), включая биологические БПВП в тяжёлых случаях.

Предлагаемое решение

В этом проекте исследователи из Института артрита Шредера (Канада) используют World Community Grid для анализа огромного объема данных из образцов кожи с участков с поражениями и без них у пациентов с псориазом или псориатическим артритом, чтобы выявить комбинации маркеров, которые играют роль в развитии, прогрессировании и лечении псориатрического артрита.

Хотя для идентификации всех клинически значимых маркеров потребовались бы тысячи образцов пациентов и тестирование астрономического количества комбинаций маркеров, что было бы невыполнимо даже для World Community Grid, метод, разработанный исследователями MCM ( https://www.cs.toronto.edu/~juris/jlab/mcm.html ), значительно снизит требуемую вычислительную мощность. Алгоритм по-прежнему требует очень высокой вычислительной мощности, но с использованием WCG он был бы реализован.

Как вы можете помочь

Волонтер World Community Grid загружает защищенную программу на любой компьютер или телефон Android. Когда устройство не использует всю свою вычислительную мощность, оно автоматически запускает в фоновом режиме имитационный эксперимент, который поможет определить маркеры псориатрического артрита (ПА). Затем устройство связывается с сервером World Community Grid, чтобы сообщить о завершении расчета.

World Community Grid получает отправленные результаты (часто называемые рабочими единицами или исследовательскими задачами), объединяет их с сотнями тысяч результатов от других добровольцев по всему миру и отправляет их группе исследователей, которая может начать анализировать данные.

Решение стать волонтером в этом проекте может ускорить идентификацию ценных молекулярных маркеров, которые помогут найти более эффективные методы лечения псориатрического артрита.

Источник: https://www.worldcommunitygrid.org/rese ... overview.s
https://boinc.ru/forum/forum/proekt-wcg/

[SETI_home_v8]

Rechenkraft.net в Makerfaire Hannover 2025: изображения и многое другое ...

Только что вернулись с прошедшей в минувшие выходные выставки Makerfair в Ганновере, где наша команда представила последние разработки компании Rechenkraft.net. Проект HoloDeck на стенде №156 в Eilenriedehalle: среда молекулярной реальности с открытым исходным кодом, основанная на настольном игровом оборудовании TiltFive, для визуализации биомолекул (или любого другого 3D-объекта, доступного в формате .glTF) для образовательных или исследовательских целей.

Важно отметить, что эта система позволяет нам визуализировать рабочие файлы нескольких проектов в области химии, естественных наук и биомедицинских распределенных вычислений, таких как, например, Rosetta@home, SiDock@home и многих других.

Наш проект был одним из семи, представленных на специальной странице объявлений MakerFaire, и, как следствие, наш стенд посетило множество людей.

Мы опубликовали несколько кратких отчетов и фотографий со стенда HoloDeck в LinkedIn, Bluesky и Mastodon, чтобы вы могли составить представление о происходящем.

Спасибо всей команде за то, что помогли воплотить это в жизнь, а также многочисленным сотрудникам RNA World и Rechenkraft.net сторонникам, а также команде Einstein@home, которые отпраздновали свое 20-летие на стенде MakerFaire №157, расположенном рядом с нашим.

Следует также отметить, что Университет Юстуса Либиха в Гессене в настоящее время финансирует разработку курса, который использует HoloDeck в учебных и исследовательских целях.
Майкл.

Rechenkraft.net e.v. - Ассоциация по образованию, исследованиям и науке с помощью сетевых компьютеров.

Справочная информация
rechenkraft.net/wiki/HoloDeck
maker-faire.de/maker/holodeck-das-rechenkraft-net-molecular-augmented-reality-environment/
tiltfive.com/
maker-faire.de/news/2025/08/maker-zeigen-geniale-projekte/
linkedin.com/feed/update/urn:li:activity:7366107866300063744/
happ/profile/mwnautilus.bsky.social/post/3lwvphafdkk2u
mstdn.social/@MWNautilus/115066215936977649
einsteinathome.org/
huni-giessen.de/en
uni-giessen.de/hessenhub/holodeck

[SETI_home_v8]

НЕИЗБЕЖНЫЙ ПРОСТОЙ: Полная миграция WCG в Nibi cloud в связи с закрытием Graham cloud 31 августа 2025 г.

Мы ожидаем, что в период с 15:00 до 17:00 31 августа 2025 года все конечные точки WCG будут отключены, поскольку мы перейдем на облако Nibi cloud. В рамках подготовки мы будем систематически отключаться, что приведет к отключению серверов.

Проекты: Составление карт раковых маркеров, Проект по дождям в Африке, Составление карт артритных маркеров
Опубликовано: 29 августа 2025 г.

Полная миграция WCG с облачных сервисов Graham на Nibi cloud будет завершена в период с 15:00 до 17:00 31 августа 2025 года

После этого Sharcnet отключит все оборудование в Graham.

Мы подали заявку в UHN Digital на перенос наших записей DNS на новые IP-адреса, которые нам были выделены в Nibi cloud, и все хранилища, сетевые и вычислительные ресурсы уже предоставлены в Nibi.

Мы продолжаем тестирование QA и Prod в новой инфраструктуре.

Мы столкнемся с некоторым простоем, поскольку *.worldcommunitygrid.org URL-адреса будут меняться. В течение следующих 48 часов мы будем последовательно отключать скрипты создания workunit, серверные компоненты BOINC и серверы загрузки, останавливать базу данных, выполнять окончательную повторную синхронизацию, а затем отключать веб-сайт, форумы и внутренние службы.

В лучшем случае, наши записи DNS будут заменены 31-го числа, и все, что связано с балансировщиком нагрузки, будет запущено. Однако мы хотим подготовить пользователей к возможному дополнительному простою, поскольку мы запускаем prod на Nibi.

https://www.worldcommunitygrid.org/abou ... icleId=826

[SETI_home_v8]

Сегодня появились несколько хороших новостей про перезапуск одного из вычислительных кластеров, подключения на нём RakeSearch и новость о возможной новой задаче в SiDock

По этой ссылке https://boinc.ru/forum/topic/shmya-clus ... stid-10033

На заре проекта RakeSearch, наш ShmyaCluster внёс немалую лепту в его становление.

Потом в RakeSearch пришли поиски с только Windows-приложением, но, зато появился SiDock@home, где он также работал под полной нагрузкой. Но несколько месяцев назад очередная мишень в SiDock@home была посчитана.

Какое-то время его узлы (№ 4 и 5) переключались между другими проектами, затем они перестали откликаться... и вот, в конце августа и первой половине сентября удалось добраться до них и:

Переустановить OS, сменив Ubuntu 18.04 LTS на 22.04 LTS;

Установить VirtualBox и создать на каждом по виртуальной машине с числом CPU, равным числу ядер (для Ryzen 3600X - 6 штук, для Ryzen 3900X - 12 штук) и Windows;

Подключить их к RakeSearch.
Спустя несколько лет ShmyaCluster возвращается в него! Как вы сами понимаете часть потоков ещё останется незадействованной... но это ненадолго. На 3900X они будут нагружены пряма сейчас - задачами, необходимыми для запуска обработки новой мишени в SiDock@home.

После недельного простоя, - сегодня днём обещают добавить новые задания в отечественный проект USPEX по материаловедению. Там тоже намечается новая и долгая работа.

Оценили 0 человек
Показать список поделившихся

[SETI_home_v8]

В проекте LHC@Home недавно появилось новое приложение XTrack (beta test)

И, несмотря на 2025 год, - выпущены версии этого приложения не только для 64 разрядных систем, но ещё и для 32 разрядных Windows и 32 разрядного Linux! Но не это самое удивительное, а то, что собралось достаточно много пользователей старых 32 разрядных систем, типа вин ХР.

https://lhcathome.cern.ch/lhcathome/for ... 2142#52142

[SETI_home_v8]

Уважаемые участники, мы временно прекращаем принимать пожертвования на SiDock@home в криптовалюте.

Если у вас есть автоматические пожертвования в адрес SiDock@home в криптовалюте, отключите их.

Наши предыдущие адреса GRC/BTC/ETH будут недоступны.

С наилучшими пожеланиями, Команда SiDock@дома.

https://www.sidock.si/sidock/forum_thread.php?id=304

[SETI_home_v8]

Необходимое действие: Сброс настроек по умолчанию

Мы сбросили проект по умолчанию для всех на пустое значение или знак прочерка «---».

Если вы используете площадку по умолчанию для назначения заданий вновь созданным узлам, например узлам, созданным в облачной службе, вам потребуется переназначить это значение.

Приносим извинения за неудобства.
https://www.primegrid.com/forum_thread.php?id=12973